SYS SEED
Integrierte Modellierung des Primärstoffwechsels des sich entwickelnden Gersten-Endosperms unter dem Einfluss hormonaler Regulierung
Projektbeschreibung
Das Vorhaben zielt auf die Analyse und systembiologische Modellierung des primären Stoffwechsels sich entwickelnder Gerstensamen.
Drei Ansätze sollen kombiniert werden: räumlich-zeitliche Modellierung von Expressionsgradienten und metabolischen Flüssen im Gerüst eines virtuell rekonstruierten wachsenden Gerstenkorns; strukturelle Modellierung zur Visualisierung und zum Vergleich transkriptioneller und metabolischer Netzwerke; kinetische Modellierung zur Etablierung eines quantitativen Netzwerkes von Assimilatflüssen und zur Vorhersage der Wirkung genetischer Veränderungen. Verschiedene Analysetechniken liefern die für die Modellierung notwendigen Daten: NMR-Spektroskopie zur räumlich-zeitlichen Visualisierung des wachsenden Korns und zur Analyse von 13C- und 15N-Flüssen nach Isotopenmarkierung; mRNA-Expressionsanalyse, Metabolit-Profiling und Messung der Aktivität ausgewählter Enzyme in Geweben und Zellkompartimenten zur Vorhersage der Assimilat-Flüsse.
Das Simulationsmodell soll Auswirkungen genetischer Veränderungen auf Kornertrag und Inhaltsstoffe sichtbar machen. Die im Projekt entwickelten Tools und Methoden sollen Ausgangspunkt zukünftiger Modellierungen sein.
Partner
Dr. Björn Junker
Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)
Corrensstr. 3
06466 Gatersleben
Dr. Klaus-Peter Götz
Humboldt Universität zu Berlin
Unter den Linden 6
10099 Berlin
Dr. Peter Geigenberger
Max-Planck-Institut für Molekulare Pflanzenphysiologie
Am Mühlenberg 1
14476 Potsdam-Golm
SYS SEED
GABI-FUTURE - BASIS01.07.2007 - 30.06.2010
Fördersumme
| Öffentlich: | 1.787.329,00 € |
| Privat: | 0,00 € |
| Gesamt: | 1.787.329,00 € |
